日前，國際學(xué)術(shù)期刊《自然·通訊》在線刊發(fā)江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院原院長顏龍安院士團(tuán)隊(duì)聯(lián)合河北大學(xué)杜會龍教授團(tuán)隊(duì)的研究成果：首個(gè)稻屬最全超級泛基因組圖譜繪制成功。
泛基因組是一個(gè)物種中所有個(gè)體基因組信息的總和，構(gòu)建泛基因組可以有效解決單一參考基因組帶來的遺傳信息分析偏差。超級泛基因組代表一個(gè)屬內(nèi)所有物種的基因組信息，尤其蘊(yùn)含了野生種中豐富的基因組變異，是對泛基因組的進(jìn)一步擴(kuò)展，在遠(yuǎn)緣雜交和基因發(fā)掘等方向具有重要應(yīng)用前景。稻屬隸屬于禾本科的稻亞科，包括2個(gè)栽培稻種和21個(gè)野生稻種。其中，野生稻為栽培稻近緣物種，是現(xiàn)代水稻品種遺傳改良和種質(zhì)創(chuàng)新的基因?qū)殠欤哂兄匾耐诰騼r(jià)值。
研究團(tuán)隊(duì)組裝了稻屬13個(gè)近乎完美的野生稻種的基因組，并結(jié)合已公開的普通野生稻、亞洲栽培稻和非洲栽培稻基因組，構(gòu)建了包含101723個(gè)基因家族的稻屬超級泛基因組。其中，稻屬共有的核心基因家族僅占9.84%，共鑒定到63881個(gè)栽培稻中尚未發(fā)現(xiàn)的新基因家族，使可利用的水稻基因擴(kuò)大了1.7倍。同時(shí)，基于高質(zhì)量的基因組圖譜，首次在基因組水平重構(gòu)了稻屬的進(jìn)化關(guān)系。
該研究構(gòu)建的稻屬超級泛基因組極大地?cái)U(kuò)展了水稻遺傳改良的基因池，對野生稻種質(zhì)創(chuàng)新利用具有重要理論意義和應(yīng)用價(jià)值，同時(shí)為稻屬進(jìn)化和馴化研究提供新的見解。（據(jù)權(quán)威消息了解王洋、李玉蘭、胡曉軍）
編輯：金杜
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